Kako otvoriti, uređivati i pretvoriti PDB datoteke
Datoteka s ekstenzijom PDB datoteke najvjerojatnije je datoteka stvorena u formatu baze podataka programa koji se koristi za držanje informacija o debugiranju programa ili modula, poput DLL ili EXE datoteke. Ponekad ih nazivaju simbolske datoteke.
PDB datoteke mapiraju različite komponente i izjave u izvornom kodu do konačnog kompiliranog proizvoda, a program za otkrivanje pogrešaka tada može koristiti za pronalaženje izvorne datoteke i lokaciju u izvršnoj mreži na kojoj treba zaustaviti postupak otklanjanja pogrešaka.
Neke datoteke PDB mogu se umjesto toga nalaziti u formatu datoteke datoteke Protein Data Bank. Te su PDB datoteke obične tekstualne datoteke koje pohranjuju koordinate vezane uz strukture proteina.
Ostale PDB datoteke vjerojatno su stvorene u Palm Database ili PalmDOC formatu i koriste se s PalmOS mobilnim operativnim sustavom . Umjesto toga, neke datoteke u ovom formatu koriste umnožak .PRC datoteke.
Kako otvoriti PDB datoteku
Razni programi koriste vlastitu PDB datoteku za spremanje podataka u neku vrstu strukturiranog formata baza podataka, tako da se svaka aplikacija koristi za otvaranje vlastite vrste PDB datoteke. Geneious, Intuit Quicken, Microsoft Visual Studio i Pegasus samo su neki od primjera programa koji bi mogli koristiti PDB datoteku kao datoteku baze podataka. Radare i PDBparse mogu poslužiti i za otvaranje PDB datoteka.
Neke datoteke PDB pohranjene su u običnom tekstu, poput Geneiousovih datoteka Debug Debug programa i potpuno su čitljive za ljude ako su otvorene u uređivaču teksta. Možete otvoriti ovu vrstu PDB datoteke s bilo kojim programom koji može čitati tekstualne dokumente, poput ugrađenog Notepad programa u sustavu Windows. Neki drugi PDB preglednici datoteka i uređivači uključuju Notepad ++ i zagrade.
Ostale DBB datoteke baze podataka nisu tekstualni dokumenti i korisni su samo kada se otvore programom za koji je namijenjen. Na primjer, ako je vaša PDB datoteka na neki način povezana s Quicken, pokušajte s tim softverom pregledavati ili urediti PDB datoteku. Visual Studio očekuje da će vidjeti PDB datoteku u istoj mapi kao i DLL ili EXE datoteka.
Možete pregledavati i uređivati PDB datoteke koje su datoteke Protein Data Bank, u sustavu Windows, Linux i MacOS s Avogadrom. Jmol, RasMol, QuickPDB i USCF Chimer mogu otvoriti i PDB datoteku. Budući da te datoteke predstavljaju običan tekst, možete otvoriti i PDB datoteku u uređivaču teksta.
Palm Desktop bi trebao biti u mogućnosti otvoriti PDB datoteke koje se nalaze u datotečnom sustavu Palm Database, no možda ćete je morati prvo preimenovati da bi ga prepoznala .PRC datotečni nastavak tog programa. Da biste otvorili PalmDOC PDB datoteku, pokušajte s STDU Viewerom.
Kako to pretvoriti PDB datoteku
Programske datoteke baze podataka najvjerojatnije neće biti pretvorene u drugi format datoteke, barem ne s redovitim alatom za pretvaranje datoteka . Umjesto toga, ako postoji alat koji može pretvoriti ovu vrstu PDB datoteke, to bi bio isti program koji ga može otvoriti.
Na primjer, ako trebate pretvoriti datoteku DBB baze podataka iz Quicken, pokušajte ga koristiti da biste to učinili. Ova vrsta pretvorbe, međutim, vjerojatno nije samo malena upotreba, već i nije podržana u ovim aplikacijama baze podataka (tj. Vjerojatno ne trebate pretvoriti ovu vrstu PDB datoteke u bilo koji drugi format).
Datoteke Protein Data Bank mogu se pretvoriti u druge formate s MeshLabom. Da biste to učinili, prvo morate pretvoriti PDB datoteku u WRL s PyMOL-om iz izbornika Datoteka> Spremi sliku kao> VRML , a zatim uvesti WRL datoteku u MeshLab i koristiti izbornik Datoteka> Izvoz mreža kao na kraju pretvoriti PDB datoteku u STL ili neki drugi format datoteke.
Ako vam model ne mora biti u boji, PDB datoteku možete izvesti izravno u STL s USCF Chimera (veza za preuzimanje je gore). U suprotnom, možete koristiti isti postupak kao i prethodno (s MeshLabom) pretvoriti PDB u WRL s USCF Chimerom, a zatim izvesti WRL datoteku u STL s MeshLabom.
Da biste pretvorili PDB u PDF ili EPUB , ako imate PalmDOC datoteku, moguće je na više načina, ali najjednostavnije je vjerojatno koristiti on-line PDB pretvarač kao što je Zamzar . Možete prenijeti PDB datoteku na tu web stranicu da biste imali mogućnost pretvoriti u one formate, kao i za AZW3, FB2, MOBI , PML, PRC, TXT i ostale formate datoteka e-knjige.
Pretvaranje PDB datoteke u FASTA format može se obaviti s Meilerovim mrežnim PDB-om na FASTA pretvaraču.
Također je moguće pretvoriti PDB u formatu CIF (kristalografske informacije) putem interneta pomoću PDBx / mmCIF.
Napredno čitanje na PDB datotekama
Mnogo više možete pročitati datoteke programa programa Microsoft, GitHub i Wintellect.
Još je više podataka o datotekama Protein Data Bank; pogledajte Worldwide Protein Data Bank i RCSB PDB.
Je li vaša datoteka još uvijek otvorena?
PDB datoteke koje se ne otvaraju s bilo kojim od alata odozgo, vjerojatno nisu zapravo PDB datoteke. Ono što se može dogoditi jest da ste pogrešno čitali datotečni nastavak; neki formati datoteka koriste sufiks koji se vrlo sliči ".PDB" kada su stvarno nepovezani i ne rade isto.
Na primjer, PDF datoteka je datoteka dokumenta, ali većina gornjih programa neće pravilno prikazati tekst i / ili slike ako pokušate otvoriti jedan s tim softverskim programima. Isto vrijedi i za ostale datoteke s istovremeno napisanim ekstenzijama datoteka, poput PD, PDE, PDC i PDO datoteka.
PBD je još jedan koji pripada programu EaseUS Todo Backup i stoga je koristan samo kada se otvori tom softverom.
Ako nemate PDB datoteku, istražite proširenje datoteke koju vaša datoteka ima da biste pronašli odgovarajući program koji će ga otvoriti ili pretvoriti.